Departamentul Chirurgie cardiovasculară și toracică cuprinde următoarele secții:
• Chirurgia malformațiilor cardiace congenitale cu reabilitare cardiologică
• Chirurgia viciilor cardiace dobândite cu reabilitare cardiologică
• Chirurgie toracică
• Chirurgie vasculară
• Radiologie intervențională cardiovasculară
• Perfuziologie cu metode extracorporale de tratament